Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP54Q7Z3B4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP54Q7Z3B4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms