Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BBS12Q6ZW61 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms