Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPN12Q6ZSI9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms