Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSSK4Q6SA08 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms