Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C11orf88Q6PI97 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C11orf88Q6PI97 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms