Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q6P435 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q6P435 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q6P435 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms