Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms