Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00303Q3SY05 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms