Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KNOP1Q1ED39 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KNOP1Q1ED39 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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