Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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