Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CNGA3Q16281 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CNGA3Q16281 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CNGA3Q16281 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CNGA3Q16281 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CNGA3Q16281 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA3Q16281 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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