Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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