Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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