Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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