Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMC1AQ14683 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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