Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCARF1Q14162 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms