Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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