Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF1Q13351 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms