Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms