Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN1BQ07699 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms