Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOX4Q06945 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms