Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FMODQ06828 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms