Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC9Q06265 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms