Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBE1Q04446 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms