Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN2Q02246 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTN2Q02246 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms