Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPEQ02224 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms