Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TNFRSF17Q02223 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF17Q02223 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms