Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACTA1P68133 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms