Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOSBP53539 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOSBP53539 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOSBP53539 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms