Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms