Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRATP43155 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRATP43155 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRATP43155 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRATP43155 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms