Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXA7P31268 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXA7P31268 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms