Protein–RNA interactions for Protein: P30990

NTS, Neurotensin/neuromedin N, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTSP30990 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTSP30990 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTSP30990 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTSP30990 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTSP30990 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTSP30990 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTSP30990 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTSP30990 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTSP30990 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms