Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCAP28676 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCAP28676 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms