Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD10P28358 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms