Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMBRP28336 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMBRP28336 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms