Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MDKP21741 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MDKP21741 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MDKP21741 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms