Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL6A2P12110 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms