Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC192P0DO97 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC192P0DO97 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms