Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms