Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFMP07197 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFMP07197 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFMP07197 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms