Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SFT2D2O95562 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SFT2D2O95562 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SFT2D2O95562 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SFT2D2O95562 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D2O95562 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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