Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPFIA3O75145 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms