Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms