Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE40O14503 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE40O14503 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms