Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms