Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCP1A6NGW2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms