Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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