Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AUP1Q9Y679 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms