Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HCN4Q9Y3Q4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HCN4Q9Y3Q4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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